În funcție de tipul donatorului de celule stem hematopoietice se disting două tipuri majore de proceduri:
- autotransplantul – în care CSH (celule stem hematopoietice) se obțin de la copil și se conservă la temperaturi foarte joase (crioprezervare)
- allotransplantul – în care se obțin CSH (celule stem hematopoietice) de la o persoană sănătoasă, înrudită sau neînrudită cu copilul.